mansion88明升(中国)

    RT-PCR实验案例解析

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    mansion88明升(中国)生物技术公司基于与客户合作的实际案例,介绍了RT-PCR的实验流程,包括RT-PCR实验所需试剂耗材、RNA提取、RNA反转录为cDNA。

    实验摘要

    使用TRIzol提取样品总RNA,反转录取得cDNA,供下游实验使用。

    1.试剂与耗材

    试剂与耗材
    Prime Script II 1st Strand cDNA Synthesis Kit,宝生物工程(大连)有限公司,6210B; 总RNA提取试剂TRIzol,南京mansion88明升(中国)生物技术有限公司,RK01-100;
    DL2000 DNA Plus Marker(100、250、500、750、1000、1500、2000 bp),南京诺唯赞生物技术有限公司,MD101。 GelStain,北京全式金生物技术有限公司,GS101-01;
    DEPC,Sigma公司,D5758-25ML; Agarose,西班牙Biowest,91622;
    离心管,美国Axygen,311-01-051; 枪头,美国Axygen;
    其它试剂均为国产分析纯。

    2.主要实验仪器

    主要实验仪器
    超微量紫外分光光度计:NanoDrop2000,Thermo公司; 台式高速冷冻离心机,美国BECKMAN公司,Allegra 21R;
    电子天平,美国AHOMS公司,AR5120; 紫外透射仪,美国Amersham Pharmacia公司,Hofer MV-25;
    电泳仪:TY2795型,BIO-RAD公司; 电泳槽:Sub-Cell GT Cell,BIO-RAD公司;
    凝胶成像分析系统:GelDocXR型,BIO-RAD公司; 雪花状制冰机,日本SANYO公司,SIM-F140AY65;
    移液器,德国Eppendorf公司。

    3.实验方法及结果

    3.1.RNA提取

    (1)组织匀浆:向样品中加入1 ml TRIzol试剂(组织块体积不要超过TRIzol体积的10%),用移液器反复吹打。

    (2)将上述匀浆液室温放置5 min,待核酸和蛋白充分解离。每1 ml TRIzol试剂用量的匀浆液中加入0.2 ml氯仿,盖紧管盖,手动剧烈震摇15 s,然后室温静置2~3 min。

    (3)4℃ 10,000 g,离心10 min。

    (4)小心吸取上层水相(无色)加入到新试管中,同时计算所吸取的水相体积。

    (5)加入所吸取水相等体积预冷的异丙醇,盖紧管盖,轻轻摇匀。

    (6)室温静置10 min,待RNA充分沉淀。

    (7)4℃ 10,000 g离心10 min。

    (8)将上清弃除(注意别丢弃沉淀),每管加入1 ml 75%乙醇润洗,盖紧管盖,轻轻晃动离心管,以去除残留的异丙醇和盐份。4℃ 7,500 g离心5 min。

    (9)将上清弃除,打开管盖,将RNA 沉淀干燥(室温挥发或真空干燥)。注意RNA沉淀不可完全干燥,否则难以溶解。

    (10)将RNA沉淀溶解于适量的无RNase水中。

    3.2.RNA琼脂糖凝胶电泳分析

    提取好的RNA进行琼脂糖凝胶电泳,电泳图如下所示:

    RNA的电泳检测

    3.3.RNA浓度及纯度测定

    RNA浓度及纯度鉴定

    3.4.RNA反转录为cDNA

    3.4.1.基因组DNA去除

    采用mansion88明升(中国)公司的DNase I,在RNase free的离心管中配制如下混合液:

    基因组DNA的去除

    3.4.2.反转录反应

    在PCR管中配制下列反应混合液:

    反转录反应体系1

    65℃反应5 min,冰浴冷却。

    在第一步的反应管中配制下列反转录反应液:

    反转录反应体系2

    反转录反应条件的设置:30℃ 10 min,42℃ 30 min,95℃ 5 min。冰浴冷却。产物至于-20℃冰箱保存。

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